（一）生产经营者自愿申请
菜田补贴由补贴对象自愿申请，由所在村村委会统一安排，通过手机APP客户端或电脑网上填报补贴信息，经本人确认和所在村村委会初步核实，导出并打印《北京市菜田补贴申请表》（附表1），一式三份，报送村委会两份，本人留存一份。
（二）村委会公示确认
村委会负责公示确认。村委会确认填报信息真实有效，张榜公布菜田补贴申请者的姓名（或名称）、补贴面积、补贴金额等，公示期为7天，公示内容（附件5）须留档（复印件或影像资料）。出现争议的，由村委会负责协调解决。村委会确认无异议后，导出并打印《北京市菜田补贴村级汇总确认表》（附表2）以及公示结果，一式三份，村委会存档一份，上报所在镇（乡）政府、街道办事处两份。同时，上报所在镇（乡）政府、街道办事处《北京市菜田补贴申请表》一套、公示留档资料一套。
（三）镇（乡）政府、街道办事处审核
镇（乡）政府、街道办事处负责审核工作。各镇（乡）政府、街道办事处逐村审核申报资料无问题后，导出并打印《北京市菜田补贴镇(乡)级汇总审核表》（附表3）及提交村级公示情况的说明（附件6），一式三份，报区农业农村局两份，各镇（乡）政府、街道办事处存档一份。同时，上报区农业农村局《北京市菜田补贴村级汇总确认表》一套。
（四）区政府审核批准
区农业农村局逐镇（乡）、街道核实申报资料无误后，导出并打印《北京市菜田补贴区级认可汇总表》（附表4）一式三份，报区政府审核批准；区政府对上报的《北京市菜田补贴区级认可汇总表》审核并批复同意后，由区农业农村局送区财政局一份，安排拨付补贴资金；同时，按照要求报市农业农村局备案一份；本级部门存档一份。
（五）补贴资金发放
区农业农村局根据区政府的批复，对各镇（乡）政府、街道办事处上报的《北京市菜田补贴镇(乡)级汇总审核表》进行批复。各镇（乡）政府、街道办事处接到区农业农村局批复同意后，按照批复内容拨付补贴资金到补贴对象的“一卡（折）通”或银行账户。各镇（乡）政府、街道办事处拨付资金后，应及时通知村委会，由村委会公告通知补贴对象核对确认补贴资金。
菜田补贴资金要按时足额发放到补贴对象手中，禁止发放现金，禁止将补贴资金用于抵扣生产经营者交费。